PCR和RTPCR哪個技術更適用於獲取目的基因

2021-03-03 21:58:47 字數 4128 閱讀 3940

1樓:八戒產權

「獲取目的基因」是實施基因工程的第一步。目的基因可以從自然界中已有的物種中分離出來,也可以用人工的方法合成。為什麼不能直接從含有目的基因的生物細胞中獲取?

因為生物細胞中所含的目的基因很少,要從浩瀚的「基因海洋」中獲得特定的目的基因,猶如大海撈針,是十分不易的。因此需要構建基因文庫或利用pcr技術擴增。

rt-pcr的原理是什麼?有何用途?

2樓:愛做作業的學生

原理是:提取組織或細胞中的總rna,以其中的mrna作為模板,採用oligo(dt)或隨機引物利用逆轉錄酶反轉錄成cdna。再以cdna為模板進行pcr擴增,而獲得目的基因或檢測基因表達。

該技術主要用於:分析基因的轉錄產物、獲取目的基因、合成cdna探針、構建rna高效轉錄系統。

rt- pcr(reverse transcription-polymerase chain reaction)即逆轉錄pcr,是將rna的反轉錄(rt)和cdna的聚合酶鏈式擴增(pcr)相結合的技術。

首先經反轉錄酶的作用從rna合成 cdna,再以cdna為模板,擴增合成目的片段。rt-pcr技術靈敏而且用途廣泛,可用於檢測細胞中基因表達水平,細胞中rna病毒的含量和直接克隆特定基因的cdna序列。

作為模板的rna可以是總rna、mrna或體外轉錄的rna產物。無論使用何種rna,關鍵是確保rna中無rna酶和基因組 dna的汙染。

用於反轉錄的引物可視實驗的具體情況選擇隨機引物、oligo dt 及基因特異性引物中的一種。對於短的不具有髮卡結構的真核細胞mrna,三種都可。

擴充套件資料

反轉錄酶的選擇

1、money 鼠白血病病毒(mmlv)反轉錄酶:有強的聚合酶活性,rna酶h活性相對較弱。最適作用溫度為37℃。

2、禽成髓細胞瘤病毒(amv)反轉錄酶:有強的聚合酶活性和rna酶h活性。最適作用溫度為42℃。

3、thermus thermophilus、thermus flavus等嗜熱微生物的熱穩定性反轉錄酶:在mn存在下,允許高溫反轉錄rna,以消除rna模板的二級結構。

4、mmlv反轉錄酶的rnase h突變體:商品名為superscript 和superscriptⅱ。此種酶較其它酶能多將更大部分的rna轉換成cdna,這一特性允許從含二級結構的、低溫反轉錄很困難的mrna模板合成較長cdna。

3樓:禁封

rt-pcr有兩種解釋:

1,最常用的理解:rt 是『逆轉錄』(reverse transcription)的縮寫

2,現在也有人這麼用:rt是『實時』(real time)的縮寫

1,先說逆轉錄pcr:

這項技術使用的『逆轉錄酶』來自逆轉錄病毒,是一種能按照鹼基互補配對原則,以脫氧核糖核苷酸為底物,以寡居dt為引物,把mrna轉換成相應dna的酶,由於該酶的效果與中心法則(dna所承載的生物資訊表達順序應該是dna-rna-蛋白)順序相反,故而有'逆轉錄'之稱。

由於逆轉錄反應使用了引物和模板,也是聚合酶鏈式擴增的(pcr是『鏈式擴增反應』polymerase chain reaction 的縮寫)故稱為rt-pcr。

再說其用途:

我們提取的rna主要是rrna,即核糖體rna,但很少有人用它做些什麼,倒是含量較少的mrna,即信使rna是中心法則所述的遺傳資訊表現的中轉站,所以我們要把微量的信使rna搞出來,更重要的是,rna太容易分解了,環境中無處不在的rna酶啊,以及其容易被水解的特點啊,讓你不得不盡快把珍貴的信使rna轉化成穩定的形式,於是就有了rt-pcr。

2, 再說實時pcr

細胞瞬時轉錄的mrna種類頗多,各種mrna含量也有實時的改變,這反映了細胞核內轉錄因子根據環境要求在做出相應的變化,realtime-pcr,以及quantitative realtime-pcr (簡稱qrt-pcr)就應運而生。

原理:利用pcr高度的特異性,通過特定的引物能在複雜樣品中得到的特定序列的dna,而這種特定dna的產量跟反應初始階段模板量是直接相關的。簡單說來。

經過一個pcr迴圈,可以把一個模板變成兩個,在經過一個迴圈,就會變成四個,以此類推。如果pcr的檢測線是1000個產物,那麼當你的初始樣品中模板是n個,那就需要經歷的迴圈數為

的時候才能檢測,這就把迴圈數與初始樣品中模板數聯絡起來了。也就是說經過計算,達到檢測限的迴圈數就能反映初始rna樣品中某種rna的含量多少。

在實際中,使用了特殊的含有熒光劑的引物,光學檢測相應光強度的產物所需的迴圈數,能高度靈敏的達到目的。

realtime-pcr有兩種。絕對定量和相對定量。

絕對定量常用於逆轉錄病毒侵染細胞的檢測,比如你想知道有多少hiv侵染了樣本中的t細胞,你可以收集一定數量的t細胞並提取rna,通過逆轉錄,以及taq酶利用hiv的特異引物進行擴增,最終的迴圈數可以反應你的這群t細胞正在被多少個hiv侵染。

相對定量常用於檢測實時的轉錄譜,例如在給藥前後,某重要基因轉錄的實時變化,可以分別收取給藥前後的全rna,用相對轉錄量不變的基因為內參,如gapdh或beta-actin,與目標基因轉錄的轉錄量對比,來定量反應藥物對目的基因轉錄含量的影響。一氣呵成,難免有錯,看著玩吧

4樓:匿名使用者

rt—pcr(reverse transcription-polymerase chain reaction)是將rna的反轉錄(rt)和cdna的聚合酶鏈式擴增(pcr)相結合的技術。首先經反轉錄酶的作用,從rna合成cdna,再以cdna為模板,在dna聚合酶作用下擴增合成目的片段。rt—pcr技術靈敏而且用途廣泛,可用於檢測細胞中基因表達水平、細胞中rna病毒的含量和直接克隆特定基因的cdna序列。

作為模板的rna可以是總rna、mrna或體外轉錄的rna產物。無論使用何種rna,關鍵是確保rna中無rna酶和基因組dna的汙染。biog rna保護劑可有效阻止rnase活性來保護rna不被降解;儲存在rna保護劑中的rna樣本在-20℃條件可儲存六個月,並且加入保護劑的rna可直接做下游實驗,無任何影響。

biog super cdna synthesis kit具有超高的靈敏度,最低可檢測到1pg總rna 中的幾十個目標rna分子,反應結果適用於後續的pcr分析、pcr克隆、定量pcr等。

5樓:匿名使用者

pcr全稱多聚酶鏈式反應,原理是dna的體外擴增。

具體來說:在ep管里加入dna、合成原料(dntp、引物)、耐熱的dna聚合酶(taq)後,放入pcr儀,pcr儀會利用升溫使dna變性,在聚合酶的作用下使單鏈複製成雙鏈,進而達到基因複製的目的。

用途:1、核酸的基礎研究:基因組克隆

2、不對稱pcr製備單鏈dna用於dna測序3、反向pcr測定未知dna區域

4、反轉錄pcr(rt-pcr)用於檢測細胞中基因表達水平、rna病毒量以及直接克隆特定基因的cdna

5、熒光定量pcr用於對pcr產物實時監控6、cdna末端快速擴增技術

7、檢測基因的表達

8、醫學應用:檢測細菌、病毒類疾病;診斷遺傳疾病;診斷腫瘤;應用於法醫物證學

6樓:淡藍521慧

rt-pcr較逆轉錄pcr,有叫反轉錄pcr,是聚合酶鏈式反應的一種廣泛應用的變形,在rt-pcr中,一條rna鏈被逆轉錄成為互補dna,在一次為模板通過pcr進行dna擴增。使用過biodai相關的實時熒光定量pcr監測,ct 值的起跳點還是挺早的。在臨床上給藥監測啥的,都是有很好的用處的。

7樓:一零啞劇

熒光定量pcr目的:在pcr反應中,無論是定性還是定量分析,分析的都是pcr的終產物。但是有時候想知道的卻是未經pcr放大之前的起始模板量,rt-pcr應用而生。

pcr技術中為什麼3次迴圈才能得到目的基因

8樓:匿名使用者

原因如下:

1、第一個迴圈擴增出來的新片段很長很長。

2、第二個迴圈以新的長片段為模板進行,但新片段的一端是引物開頭的,所以第二個迴圈得到的片段就是我們需要的長度,但只是一條鏈,所以還不能分離出目的基因。

3、第三個迴圈,當以第二個迴圈得到的新片段為模板時,因為這個片段的長度就是需要擴增的長度,當第三個迴圈完成時,這個片段是需要的長度,且是雙鏈dna,這就得到了需要的目的基因了。

9樓:蕭峰虛竹與段譽

因為在前兩個迴圈內產生的dna鏈中都會有除目的基因外的多餘部分,只有到了第三次迴圈才會得到只有目的基因的dna鏈。

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