1樓:我不是他舅
unigene其實來沒有一個標準的定義。自大體的概念是經過去冗餘之後得到的基因序列,這條序列和其他的序列是非冗餘的,也就是理論上其他序列都和此序列代表的不是同一個基因。或者是經過聚類後得到的不同的類,類和類之間是非冗餘的,每個類可以認為唯一的代表一個基因。
不同的去冗餘和聚類的方法得到的結果都可以稱為unigene。
另外ncbi上也有unigene的概念,是ncbi用自己的方法對序列進行聚類,它認為每一個類都唯一的代表一個基因,並賦予一個編號:物種名字.數字,比如小麥的一個例子:
ta.191,這也是較常用的unigene.
如何將測序資料上傳到ncbi的sra資料庫
2樓:匿名使用者
一般上傳資料到ncbi sra的過程需要6步:
1、create a bioproject for this research
2、create a biosample submission for your biological sample(s)
3、gather sequence data files
4、enter metadata on sra website
a、create sra submission
b、create experiment(s) and link to bioproject and biosample
c、create run(s)
5、transfer data files to sra
6、update submission with pubmed links, release date, or metadata changes
需要注意的一點是,上傳的過程中很多地方一旦儲存或提交就不可以修改,尤其是各處的alias。但是,可以聯絡ncbi的工作人員修改內容。ncbi的工作效率是很高的,一般不超過48小時,就可以得到確認,並拿到登入號。
3樓:布達拉宮花園
隨著高通量測序的發展,海量的資料來源源不斷的產生,以至於美國國家生物
版技術資訊權中心(ncbi)都受不了了,由於經費不足,於2023年2月關閉了sequence read archive(sra)資料庫,停止接受使用者提交的下一代測序資料。
近日,google和tpg biotech聯合投資1500萬美元致力於打造dna雲資料庫,google將和dnanexus一起接管ncbi的海量資料庫,繼續為科研人員提供免費的dna資料資訊。
ncbi**的雙端測序的sra資料處理?求生物大神解答... 10
4樓:匿名使用者
請問你的問題解決了嗎?我也遇到了同樣的問題
5樓:匿名使用者
應該是3次copies
在氣相色譜的實驗中測得一組資料，但是所得的分離度卻為為零說明什麼問題 急需要大家的幫忙，急急急！謝謝
汗。分離度為o的話，說明兩個峰是完全沒有分離開，也就是說，是一根峰，你用肉眼是看不到分離的。而分離度本身說的就是兩根峰之間的分離情況。所以，你得到的結果是因為你工作站選取的報告模式有問題或是計算本身有問題了。中國藥典2010附錄 d 3 無論是定性鑑別還是定量分析，均要求待測峰與其他峰 內標峰或特定...
dna甲基化全基因組測序需要完整的基因組註釋嗎
測序覆蓋度 基因組被測序得到的鹼基覆蓋的比例 測序覆蓋度是反映測序隨機性的指標之一 測序序深度與覆蓋度之間的關係可以過lander waterman model 1988 來確定。當深度達到5x時，則可覆蓋基因組的約99.4 以上。全基因組測序有什麼意義？隨著全球經濟形勢的變化，每個人一生都應該做一...
基因組測序的原理與方法及關進裝置
全基因組測序是對未知基因組序列的物種進行個體的基因組測序。1986年，renato dulbecco是最早提出人類基因組定序的科學家之一。他認為如果能夠知道所有人類基因的序列，對於癌症的研究將會很有幫助。美國能源部 doe 與美國國家衛生研究院 nih 分別在1986年與1987年加入人類基因組計劃...