1樓:順反子
基因庫是一個虛擬的copy概念。指bai一個種群裡所有個體
du的所有基因zhi。
基因文庫是貯存某物dao種基因的一個微生物群體。比如,我們可以把人類的所有基因用限制酶切割後,用dna連線酶將這些基因片斷和運載體連線,匯入到細菌細胞,然後大量培養這些細菌細胞,就形成了一個基因文庫。這些基因文庫含有某物種的全部種類的基因,又叫基因組文庫。
所以,基因文庫包括基因組文庫。
2樓:1986胡蘿蔔素
基因庫由所有基因組成,包括人類,動植物,微生物等所有自然界生命的基回
因。基因文庫是目答
前人類實驗室研究過的,寫到文字上的,即所有研究過的基因組成。基因組是按組別分的,如把人的分一組,猴子的分一組這樣命名的。
基因庫與基因組文庫區別
3樓:匿名使用者
基因bai庫和基因組文庫是兩個du完全不同的概zhi念。
首先,基因dao庫是指一個生物種群的全專部等位基屬因的總稱,屬於遺傳範疇。
基因組文庫屬於基因工程範疇,用於獲得未知序列的目的基因。而基因文庫分為基因組文庫和cdna文庫。基因組文庫含有一種生物的全部基因。
而cdna文庫含有一種生物的部分基因。因為cdna是由信使rna逆轉錄得到的,沒有了原來基因裡的內含子。
基因庫是指一個生物種群的全部等位基因的總稱,它不用提取出來。
而基因組文庫是基因工程提取目的基因是要用到,要先提取出來,匯入到受體細胞裡進行培養儲存。
基因文庫是怎麼回事?
4樓:北京索萊寶科技****
基因文庫包括基因組文庫和部分基因文庫。將含有某種生物不同基因的許多dn**段,匯入受體菌的群體中儲存,各個受體菌分別含有這種生物的不同的基因,稱為基因文庫。
一個基因文庫中應包含的克隆數目與該生物的基因組的大小和被克隆dn**段的長度有關。原核生物的基因組較小,需要的克隆數也較少;真核生物的基因組較大,克隆數需相應增加,才能包含所有的基因。此外,每一載體dna中所允許插入的外源dn**段的長度較大,則所需總克隆數越少;反之則所需數越多。
如果一個基因文庫的總克隆數較少,則從中篩選基因雖然比較容易,但給以後的分析造成困難,因為片段的長度增加了。如果要使每一克隆中的dn**段縮短,就須增加克隆數,所以在建立基因文庫前應根據研究目的來確定 dn**段的長度和克隆的數目。l.
克拉克和j.卡邦在2023年提出一個統計學的公式來計算某一基因文庫中所應包含的克隆數目。在建立基因文庫時,任何一個dn**段都是在隨機的基礎上被克隆的。
在公式中,p 是從建成的基因文庫中可能選出某一基因的概率,這一數字由工作者根據需要選定。基因文庫中每一克隆所含外源dn**段的平均長度,可根據該生物基因組大小和所用載體可容納的外源 dn**段的長度決定。g是該生物基因組的大小,基因組大小和dn**段長度的單位可用道爾頓或鹼基對錶示。
n 是這一基因文庫所應包含的克隆數目。
5樓:匿名使用者
基因文庫簡單說就是將細胞中的所有dna用酶切成小片段,並將每一段利用載體轉入宿主細胞中,這樣經過培養後,每一個菌株都含有一小段dna,再利用特殊方法將要檢查的目的基因挑選出來菌株,提取dna後進行測序,
之所以用基因文庫是因為,直接測基因組dna,太大了,測不準,而利用載體進入宿主細胞之後,dn**段可以隨宿主細胞一起復制,可以得到很多相同的拷貝,方便檢查
6樓:冰藍雅梅
"建立基因文庫怎麼就能知道目的基因的鹼基序列了"這樣的理解是錯誤的。基因文庫,就相當於一個圖書館;目的基因,相當於一本你要找的書。但這個圖書館的管理不怎麼樣,所以想要馬上找到目的基因是相當困難的。
必須用基因探針等方法,經過複雜細微的過程,才可以得到目的基因。
7樓:苦丁奶茶
基因文庫是指某一生物型別全部基因的集合。這種集合是以重組體形式出現。某生物dn**段群體與載體分子重組,重組後轉化宿主細胞,轉化細胞在選擇培養基上生長出的單個菌落(或噬菌斑)(或成活細胞)即為一個dn**段的克隆。
全部dn**段克隆的集合體即為該生物的基因文庫。 構建基因文庫的意義不只是使生物的遺傳資訊以穩定的重組體形式貯存起來,更重要的是它是分離克隆目的基因的主要途徑。對於複雜的染色體dna分子來說,單個基因所佔比例十分微小,要想從龐大的基因組中將其分離出來,一般需要先進行擴增,所以需要構建基因文庫。
在很多情況下目的基因的分離都離不開基因文庫。此外基因文庫也是複雜基因組作圖的重要依據。基因文庫構建包括以下基本程式:
1 dna提取及片段化,或是cdna的合成。 2 載體的選擇及製備。 3 dn**段或cdna與載體連線。
4 重組體轉化宿主細胞。 5 轉化細胞的篩選。當獲得了含重組體的宿主細胞時,即完成了基因的克隆。
基因的克隆只是分離基因的基礎,基因克隆後還要對克隆的基因進行分離,即利用各種手段把目的基因從文庫中分離出來。分離出目的基因還必須對其進行必要的檢測與分析:如進行序列測定,體外轉錄及翻譯、功能互補實驗等。
通過這些實驗確定出基因的結構及功能。到這時才能算分離到了目的基因。所以,基因的克隆、克隆基因的分離、分離基因的鑑定是利用基因文庫技術分離目的基因的主要內容。
一、基因文庫的類別 1. 基因組文庫與cdna文庫 根據基因型別,基因文庫可分為基因組文庫及cdna文庫。基因組文庫是指將某生物的全部基因組dna切割成一定長度的dn**段克隆到某種載體上而形成的集合。 cdna文庫是指某生物某一發育時期所轉錄的mrna經反轉錄形成的cdn**段與某種載體連線而形成的克隆的集合。
基因組文庫根據dna**又有核基因組文庫、葉綠體基因組文庫及線粒體基因組文庫。 基因組文庫與cdna文庫的區別在於cdna文庫是有時效性的。文庫構建時的資訊供體是某一時空條件下的細胞總mrna,它是在轉錄水平上反映該生物在某一特定發育時期,某一特定組織(或器官)在某種環境條件下的基因表達情況,並不能包括該生物有機體的全部基因。
在某種意義上講它可以表現基因組的功能資訊。再者,cdna文庫只反映mrna的分子結構。cdna中不含有真核基因的間隔序列及調控區,確切說cdna並不是真正意義上的基因。
基因組文庫構建時遺傳資訊供體是基因組dna,因而無發育時期及組織器官特異性,在一個完全的基因組文庫中包含著基因組dna上的所有編碼區及非編碼區序列的克隆。生物有機體的每一個基因在文庫中都有其克隆,該克隆的基因片段裡包括著間隔序列,所以基因組文庫可真實地顯示基因組的全部結構資訊。目前這兩類基因文庫在基因工程中都得到有效應用。
選擇哪一種,主要是根據實驗目的。在分離rna病毒基因,研究功能蛋白序列,分離特定發育階段或特定組織特異表達的基因時應構建cdna文庫。在研究mrna分子中不存在的序列及基因組作圖時必須構建核基因組文庫。
2. 克隆文庫及表達文庫從基因文庫的功能上看可分為克隆文庫及表達文庫。克隆文庫由克隆載體構建。載體中具複製子、多克隆位點及選擇標記,可通過細菌培養使克隆片斷大量增殖。
表達文庫是用表達載體構建。載體中除上述元件外,還具有控制基因表達的序列(如啟動子、sd序列、atg、終止子等),可在宿主細胞中表達出克隆片段的編碼產物。表達載體又有融合蛋白表達載體及天然蛋白表達載體之分。
從克隆文庫中分離目的克隆時主要利用核酸探針,可以是根據蛋白質序列合成的寡核苷酸探針,也可以是同種或同屬生物的同源序列探針。從表達文庫中分離目的克隆時,因克隆片段的表達產物蛋白質具有抗原性及生物活性,所以除核酸探針外,還可以利用免疫學探針及生物功能進行篩選。表達文庫適合於那些不知道蛋白質的氨基酸序列、不能用核酸類探針篩選的目的基因的分離。
3.不同載體的基因文庫 目前用於構建基因文庫的載體主要有質粒、噬菌體、黏粒及人工染色體四大類。每類中又有許多不同的載體。不同的載體適於構建不同的基因文庫。
(1). 質粒文庫 質粒是最早用於基因克隆的載體。現已有各種適用於不同工作的如克隆、表達、測序等專用商品質粒。但在構建基因文庫上,由於質粒相對較小並只能容納比自身更小的片段,因此它不能用於構建核基因組文庫,通常只用來構建短序列的克隆文庫。
例如葉綠體dna分子較小,可以用質粒構建葉綠體dna文庫。質粒載體可用於生物cdna文庫構建。但只適合於高丰度的mrna。
(2). 噬菌體文庫 目前用於基因克隆的噬菌體載體及其衍生載體很多,如單鏈的m13噬菌體載體、λ噬菌體載體、p1噬菌體載體、噬菌粒(phagemid或pha**id)等。其中使用最多的是入噬菌體。 λ-dna為雙鏈結構,長49kb。
線性分子兩端各有一條12個核苷酸的黏性末端稱cos位點。分子中有約15kb可去掉的非必要基因區,又稱「填充區」, 「填充區」兩側的序列含有其增殖所必需的全部基因,稱為左、右臂。「填充區」可被外源dna取代,構成重組體,這是它成為克隆載體的結構基礎。
由於噬菌體頭部包裝容量的限制,重組λ-dna分子大小只能在39—52kb之間。(3). 黏粒文庫 黏粒(co**id)也稱柯斯質粒,是人工構建的由λ噬菌體的cos序列、質粒的複製子序列及抗生素抗性基因序列組合而成的一類特殊的質粒載體。cos序列是dna包裝進噬菌體顆粒所必須的。
複製子通常是使用colel或pmbl的複製起始位點。黏粒具有λ噬菌體的某些性質,在克隆了大小合適的外源dn**段並且在體外被包裝成噬菌體顆粒後,能高效轉導對入噬菌體敏感的大腸桿菌宿主細胞。在宿主細胞內按λ噬菌體方式環化,但不能通過溶菌週期,無法形成子代噬菌體顆粒(因分子中不具入噬菌體全部必要基因)。
它也具有質粒載體的主要性質,在宿主細胞內可以像其他質粒一樣複製,並與鬆弛型質粒相同,適量的氯黴素可促進擴增。因具抗生素基因,可以通過抗生素抗性篩選重組子。黏粒載體在構建時也加上了設在插入失活基因內的多克隆位點。
黏粒載體的分子較小(2.8—24kb),但克隆容量很高,對外源dna長度的要求是30~45 kb,上限幾乎是入噬菌體載體容量(23 kb)的2倍,所以黏粒載體在核基因組文庫構建上具有相當的優勢,可克隆包括3,和5』調控區在內的完整的植物基因。(4).人工染色體文庫 人工染色體載體是利用真核生物染色體或原核生物基因組的功能元件構建的能克隆大於50kbdn**段的人工載體。其中有的載體既可用於克隆,又能直接轉化,是進行基因功能研究的良好載體。
近年來陸續發展起來的人工染色體文庫有yac庫、bac庫、bibac庫、pac庫及tac庫。
二、核基因組文庫構建核基因組文庫構建主要使用λ噬菌體置換型載體或黏粒載體。 1. 隨機文庫克隆數目隨機文庫指代表基因組各部分dna的摩爾數相等。對於隨機文庫:
n = ln(1-p) ; ln(1-x/y) n:克隆數目 p:設定的概率值(如:
0.99,表示在片段隨機分佈時,從文庫中找到任一序列的概率不低於0.99) x:插入片段平均大小(15~20kb) y:基因組的大小(以kb計) 如果插入片段平均大小為20kb,某基因組大小為4x108bp,p = 0.99時,根據上式n = 1x105。
含1xlo5個克隆的基因文庫相當覆蓋了5倍的基因組,在片段隨機分佈時,從文庫中找到任一序列的概率不低於0.99。隨機片段可通過機械切割或限制酶消化產生。機械切割法可獲得較均一的隨機片段,但片段不能直接用於克隆,需經末端修飾、甲基化,連上接頭後再用限制性內切酶消化產生黏性末端。
用限制酶消化的方法雖然可直接產生黏性末端,但片段的隨機性較差,所以採用後種方法時,文庫的克隆數目應大於計算值。
三、利用pcr技術構建c dna文庫 cdna文庫構建的起始資訊物質是mrna。因此構建cdna文庫首先要考慮的問題是mrna的含量及質量。生物細胞中mrna含量較低。
通常cdna文庫構建需要ug級的mrna。對於低丰度的mrna(<0.5%),要通過富集或增大克隆數目來保證構建的文庫中能夠含有它們的克隆
基因文庫是什麼,基因文庫是怎麼回事？
將整個基因組或基因組的一部分進行酶切以後。將所有的片段連入特定的質粒，然後轉入一般是細菌或酵母內，所構成的一個不同大小和片段組成的集合就是基因文庫 把一個物種的基因匯入細菌中儲存就是，根據是否是所有的基因可以分為基因組文庫和部分基因文庫 基因文庫是怎麼回事？基因文庫包括基因組文庫和部分基因文庫。將含...
功能基因組學的後基因組學,什麼是功能基因組學
功能基因組學 functional genomics 又往往被稱為後基因組學 postgenomics 它利用結構基因組所提供的資訊和產物，發展和應用新的實驗手段，通過在基因組或系統水平上全面分析基因的功能，使得生物學研究從對單一基因或蛋白質得研究轉向多個基因或蛋白質同時進行系統的研究。這是在基因組...
dna甲基化全基因組測序需要完整的基因組註釋嗎
測序覆蓋度 基因組被測序得到的鹼基覆蓋的比例 測序覆蓋度是反映測序隨機性的指標之一 測序序深度與覆蓋度之間的關係可以過lander waterman model 1988 來確定。當深度達到5x時，則可覆蓋基因組的約99.4 以上。全基因組測序有什麼意義？隨著全球經濟形勢的變化，每個人一生都應該做一...