illumina測序資料檔案有多大

2021-05-05 23:11:31 字數 3487 閱讀 9751

1樓:

illumina近日宣佈,其測序平臺的軟體有了突破性的改進,能進行實時分析,並顯著降低了計算機執行設施的需求。這些軟體改進,再加上新的genome analyzer iix,讓研究人員相對genome analyzer ii而言,測序產量能提高65%。然而,與當今資料越多,所需的計算能力也要相應提高的趨勢截然相反,illumina正通過實現儀器控制工作臺的鹼基檢出和質量評估,來簡化計算和資料處理。

illumina進一步優化了影象處理和資料分析,來支援測序產量的提高。軟體改進包括改良的簇檢測,每個流動池的讀長增加40%,更低的錯誤率。演算法優化上的突破讓標準的儀器控制檯能將實時的鹼基檢出和資料處理相整合,而無需轉移大的資料檔案,並將資料儲存的需要最小化。

最新的genome analyzer iix創新實現了資料產量和質量的顯著提高,代表了genome analyzer開發道路上一個重要的里程碑。新產品簡化了從樣品製備到資料分析的流程,增加了資料產量和質量,並擴充套件了genome analyzer的應用。

genome analyzer iix有兩個核心特徵:其一是更大的試劑冷卻器,支援超過100個測序迴圈,進一步提升了系統的易用性和自動化;其二是全新的流動池支架,讓每輪執行所得的高質量資料增加20%。依靠這些軟體和試劑的改進,genome analyzer iix現在能夠100 bp以上的配對末端讀長,並在每次執行中產生超過20 gb的高質量資料。

genome analyzer ii的使用者只需訂購genome analyzer iix upgrade kit,就能輕鬆升級到全新的系統。

華大基因illumina-hiseq測序結果怎麼看

2樓:紫羅蘭丶花開

過長的測序週期以及上萬美元的儀器成本,成了阻礙基因測序進入尋常百姓家的障礙。而運用新技術的基因測序儀大大降低了基因組測序的門檻,使得更多研究人員能夠使用這項技術開發多種應用。

illumina hiseq x ten和2000的測序資料有什麼區別

3樓:健振韋天

不清楚這個易瑞什麼來路,目前的基因檢測主要有2類,一類是通過snp位點(基本上是以snp晶片為手段,也有針對單基因或少數幾個基因位點的使用的是pcr加測序或分型的方式),還有一類是對全基因組進行測序,一般目前採用的是hiseq x-ten測序。

**上第一種如果是幾百萬個snp位點的一般是1000元左右,如果是單基因或少數幾個基因的也就幾十塊錢。第二種全基因組測序的一般測序深度30x以上,90g左右資料,測序費用大概在8000左右,分析snp和indel的變異費用在1000左右。

但是,目前完全不建議做。因為snp的變異與疾病和表型的研究完全不夠充分。單基因的遺傳疾病根本不用測序自己就看出來了,多基因的複雜疾病基因遺傳因素所佔比例有限,只是一個相關概率問題,而且即便知道了也沒什麼手段,早點拿到的資料也是一堆atcg和snp變異和所謂風險值。

還有測序和資料分析費用在飛速下降,目前上萬的全基因組測序同樣的資料可能1年後只用幾百塊,真正有效的解讀也還要等到幾年後,沒必要花這個冤枉錢。

但是以下人群有這個切實需要:腫瘤的突變分型(目前並沒有特別靠譜的高通量測序產品,主要還是基於熒光定量pcr的檢測試劑盒),新生兒的遺傳病篩查(看個人接受程度)

測序資料量越多越好嗎?

4樓:匿名使用者

不是,只要有針對性就可以了。講求實效。

5樓:韓小霞

個別存在疑問數量多用來確定。其他正確沒必要那麼多資料.

illumina最新的試劑(上機測序試劑)有哪些

6樓:匿名使用者

他們是兩

抄家不同公司的測序襲平臺1.原理illumina的hiseq2000和454都是通過bai

單序du列的擴增放大訊號,只zhi是hiseq2000中間有橋式擴增,可dao以兩頭測序。測序長度來講,hiseq2000一般為1x100和2x100的模式,而454平均500bp左右,最長700左右,測序準確度來講hiseq的測序準確度稍高一些,454由於在測序的過程每次是加一種鹼基,所有如果是單鹼基重複,比如aaaa,那麼區分幾個a的準確性就會下降。2.

資料分析和應用方向資料分析相差不大,只是不同的軟體,應用方面兩者各有優勢,hiseq2000資料適應性更高。454一般是巨集基因組種群丰度測序上應用更好一些,不過illumina也有miseq代替。3.

通量和**hiseq2000的通量要高一些,**比454便宜很多。綜合來講454現在應用面比較窄了,所以在市場上現在也慢慢被代替掉了。現在耗材和試劑也很快就停服務了。

不過hiseq現在市場上也都2500居多了,並且現在也有新的的技術更新的3000和4000。說實話現在hiseq2000也很少了。

illumina測序儀可以一次測多少個文庫

7樓:

是按資料量計算的,每個lane(可以理解為泳道或者上樣槽),每個lane有固定的資料產出,所以如果文庫上樣量大,則上的文庫就少,反之文庫多

基因測序龍頭老大illumina到底有多牛

8樓:匿名使用者

illumina近日宣佈,其測序平臺的軟體有了突破性的改進,能進行實時分析,並顯著降低了計算機執行設施的需求。這些軟體改進,再加上新的genome analyzer iix,讓研究人員相對genome analyzer ii而言,測序產量能提高65%。然而,與當今資料越多,所需的計算能力也要相應提高的趨勢截然相反,illumina正通過實現儀器控制工作臺的鹼基檢出和質量評估,來簡化計算和資料處理。

illumina進一步優化了影象處理和資料分析,來支援測序產量的提高。軟體改進包括改良的簇檢測,每個流動池的讀長增加40%,更低的錯誤率。演算法優化上的突破讓標準的儀器控制檯能將實時的鹼基檢出和資料處理相整合,而無需轉移大的資料檔案,並將資料儲存的需要最小化。

最新的genome analyzer iix創新實現了資料產量和質量的顯著提高,代表了genome analyzer開發道路上一個重要的里程碑。新產品簡化了從樣品製備到資料分析的流程,增加了資料產量和質量,並擴充套件了genome analyzer的應用。

genome analyzer iix有兩個核心特徵:其一是更大的試劑冷卻器,支援超過100個測序迴圈,進一步提升了系統的易用性和自動化;其二是全新的流動池支架,讓每輪執行所得的高質量資料增加20%。依靠這些軟體和試劑的改進,genome analyzer iix現在能夠100 bp以上的配對末端讀長,並在每次執行中產生超過20 gb的高質量資料。

genome analyzer ii的使用者只需訂購genome analyzer iix upgrade kit,就能輕鬆升級到全新的系統。

illumina二代測序的比較完整的介紹,比如什麼是文庫,什麼是測序深度

9樓:林少鳳

不同的測序型別這個對於濃度 純度 總量完整度都有不同的要求 主要是你用來那資料是做什麼,如常見基因組樣品,總量要在1微克以上,且條帶明顯。

公司檔案管理方案怎麼寫,公司資料檔案整理方法

檔案的收集 整理 保管 鑑定 統計和提供利用的活動。檔案內容包括 檔案收集 檔案整理 檔案錄入 檔案數位化 檔案系統 檔案軟體定製 檔案價值鑑定 檔案保管 檔案編目和檔案檢索 檔案統計 檔判悶案和研究 見檔案文獻編纂 檔案提供利用 檔案銷毀。這些工作的劃分只是相對穩定而不是絕對的,也有分為 8個環節...

資料匯入南方CASS彈出該資料檔案格式不對錯誤點名89,但是仔細檢查並沒有輸入錯誤,後又出現同樣情況,急

肯定還是南bai 方cass資料文du件格式有誤,檢查第89行數zhi據吧。dao 每行資料的格式如下 點號,版,權y座標,x座標,高程 可能第89行資料的有誤,既有可能沒有回車換行,或者使用了中文逗號分隔資料型別,就會出現此類錯誤。不知你是怎樣匯入的,如果方法正確還出現那樣的問題,建議你解除安裝重...

南方CASS的“高程點生成資料檔案”功能

1 開啟cass軟體,選擇選單欄 繪圖處理 展野外測點點號。2 滑鼠左鍵單擊展野外測點點號,輸入合適的繪圖比例,輸入好之後,右鍵確定。3 接著,彈出對話方塊後,選擇提前製作好的dat檔案。4 選擇好之後,左鍵單擊開啟,匯入資料。5 單擊開啟後,變可將資料匯入,效果如圖所示。6 放大,如圖所示效果。注...