您好，向您求助下，如何查詢某蛋白質的轉錄因子有哪些？

1樓：網友

用來設計實驗或者課題，可以先到google搜一下「transcription factor binding site prediction".會得到一些免費網上的服務，輸入你要研究的蛋白質啟動子。

的序列，可以得到根據轉錄因子結合位點序列而計算出的可能的結合位點（有方向性的）。

如果不清楚啟動子的長度，可以選取2-5000 bp的上游序列。設計實驗的時候，可以做系列縮短。比如轉殖500， 1000， 1500， 2000等長度，到報告基因的上游，轉染細胞後測量報告基因的活性。

得到啟動子的位置。

得到啟動子後，針對**的轉錄因子結合位點，可以做點突變，破壞結合位點後，看報告基因的活性是否改變。如果有顯著改變，說明該轉錄因子對該蛋白基因的表達有控制作用。

2樓：網友

這個。我覺得吧，還是老老實實的看文獻比較靠譜~~針對你的蛋白所在的代謝或者訊號通路去找相關文獻資料~~也可以去分析該蛋白基因的啟動子。

分析啟動子中可能的元件，然後去找每個元件可能是哪類轉錄因子。

的結合位點，不過**的東西都不是很靠譜~~~分析起來也不會輕鬆簡單。

如何實驗證明某一蛋白影響某一轉錄因子

3樓：弓揚完南琴

怎麼證明乙個蛋白是轉錄因慎告子。

從你的描述來看，是要做功能研究。有這樣幾個思路：

第一，先分析該蛋白的氨基酸序列，看有無dna結合區。和其他的轉錄因子有無功能同源區。

第二，證實該蛋毀殲白有轉錄活性。分別overexpress或者silence後，做差減pcr，篩查下游基因。

第三，證實該蛋白有dna結合能力。找到下游基因，纖孝衝或者發現同源轉錄因子後，做gel

shift實驗。

如何排除乙個蛋白是否是乙個基因的轉錄因子

4樓：聽風

1你要純化蛋白並對其進行序列和結構分析，2你要將蛋白的和dna的結合部位找到（chip可以做到，需要的是能製備蛋白的抗體）

3 酵母單雜交，在報告基因上游轉殖你的蛋白結合的啟動子。

將你的目標蛋白加入體系看能否表達，表達就說明是轉錄因子。

否則不是。當然，可能你的目標蛋白不能和dna結合，那麼你在做chip的時候就會發現沒有dna與蛋白的結合，也可能你的蛋白只和dna結合但不能啟用轉錄的起始，這就需要你通過蛋白的結構將蛋白質的dna結合區與一廣譜轉錄啟用因子結合，從而驗證其功能。

chip：染色體免疫共沉澱。

第一步：用甲醛在體內將dna結合蛋白與dna交聯。

第二步：分離染色體（質），剪下後的dna小片段與結合蛋白結合。

第三步：用特異性抗體與dna結合蛋白結合，用沉澱法分離複合體。反向交聯操作釋放出dna，並消化蛋白質。

第四步：用pcr擴增。

特異dna序列，以確定是否與抗體共沉澱。