1樓：匿名使用者
曾經是2023年最值得關注的技術。
遺傳上除了atgc這四種鹼基，人們對第五種鹼基-甲基化的胞嘧啶的興趣也日益增加。甲基化修飾的存在對dna轉錄的調控起了重要作用，異常的甲基化往往是許多疾病的起因。既然如此重要，系統繪製甲基化組的方法自然也多了起來。
甲基化組（methylome）這個詞還不太常見，它指的是全基因組範圍內的甲基胞嘧啶。
美國salk生物研究院的joseph ecker及其同事剛剛通過高通量測序的方法，展現了一張人胚胎幹細胞中所有甲基胞嘧啶的完整圖譜。這是第一張單鹼基解析度的哺乳動物甲基化圖譜，並伴隨著mrna和小rna以及一些組蛋白修飾的比較分析。他們發現胚胎幹細胞中近四分之一的甲基化是在非cg背景下，暗示胚胎幹細胞採用不同的甲基化機制來影響基因調控。
隨著es細胞的誘導分化，非cg甲基化消失，而在ipsc中還原。這張圖譜為未來人類疾病和發育中的表觀遺傳學修飾研究打下了基礎。
美國whitehead研究院的meissner等也曾繪製了類似的圖譜。他們利用高通量的亞硫酸氫鹽測序和單分子測序，產生了覆蓋大部分cpg島的dna甲基化圖譜。他們發現，dna甲基化模式與組蛋白甲基化模式的相關性比基因組序列更好；cpg的甲基化是動態的表觀遺傳標誌，在細胞分化期間經歷大量的改變。
他們還發現，胚胎幹細胞和原代細胞中與發育調控相關的「弱」cpg島在體外增殖期間經歷了異常的超甲基化，讓人想起某些原發腫瘤。
另外，兩個獨立的研究小組，分別為哈佛大學的ge***e church等，以及加州大學的kun zhang連同弗吉尼亞聯邦大學的yuan gao等，也將傳統的甲基化工具如dna的重亞硫酸鹽轉化與目標基因組捕獲技術和高通量測序相結合，定量測定人基因組中的甲基化。
核小體定位與組蛋白甲基化的關係，組蛋白甲基化是什麼意思
呵呵，bai你是大學生麼，這個問題很du 容易理解。1.首先你知zhi道核dao 小體中組蛋白是動態組 回裝和解離的答，不是一直在dna上不變化的。2.組蛋白的精氨酸和賴氨酸位點可以被甲基化，不同位點的甲基化對基因轉錄的調控作用不同，其中你說的h3k4me3表示h3組蛋白分子上的4號賴氨酸三甲基化，...
全基因組甲基化測序,應該測多少,全基因組甲基化測序需要做重複嗎
測序覆蓋bai度 基因組被測序得到 du的鹼基zhi覆蓋的比例 測序覆dao蓋度是反映 版測序隨機性的指權標之一 測序序深度與覆蓋度之間的關係可以過lander waterman model 1988 來確定。當深度達到5x時,則可覆蓋基因組的約99.4 以上。全基因組甲基化測序需要做重複嗎 不用做...
dna甲基化全基因組測序需要完整的基因組註釋嗎
測序覆蓋度 基因組被測序得到的鹼基覆蓋的比例 測序覆蓋度是反映測序隨機性的指標之一 測序序深度與覆蓋度之間的關係可以過lander waterman model 1988 來確定。當深度達到5x時，則可覆蓋基因組的約99.4 以上。全基因組測序有什麼意義？隨著全球經濟形勢的變化，每個人一生都應該做一...