1樓：匿名使用者
可以簡單理解為深度是一條鏈上一個鹼基檢測到的次數,
覆蓋度是你檢測到的這個樣本的總鹼基數的百分比
高通量基因組測序中，什麼是測序深度和覆蓋
2樓：匿名使用者
簡潔版：
深度即：測序得到的總鹼基數/基因組鹼基數 。也可以理解為將基因組測了幾遍。
測序深度能減少假陽性和測序錯誤率。 覆蓋度原來是指基因/轉錄組上測序測到的部分佔整個組的比例，但是現在很多人把coverage也直接當depth用了。
詳細版： depth嘛，就是被測基因組上單個鹼基被測序的平均次數，比如某樣本的測序深度為30x，那麼就是說該樣本的基因組上每一個單鹼基平均被測序（或者說讀取）了30次，注意，是平均。當然了，depth也有最大和最小值，這個都可以由資訊分析得到。
coverage就好理解了，由於大片段拼接的gap、測序讀長有限、重複序列等問題的存在，測序分析後組裝得到的基因組序列通常無法完全覆蓋所有區域，覆蓋度就是最終得到的結果佔整個基因組的比例。例如一個人的基因組測序，覆蓋度為98.5%，那麼說明該基因組還有1.
5%的區域通過我們的組裝和分析無法得到。
至於什麼演算法之類的，太深了，應該不用瞭解吧~~偶也寫不出來。。。:p
當然，轉錄組也同上，
3樓：豆穎環力學
可以簡單理解為深度是一條鏈上一個鹼基檢測到的次數,
覆蓋度是你檢測到的這個樣本的總鹼基數的百分比
高通量測序中深度和覆蓋度是什麼意思
4樓：**ile我的愛人
可以簡單理解為深度是一條鏈上一個鹼基檢測到的次數，覆蓋度是你檢測到的這個樣本的總鹼基數的百分比
為什麼高通量測序dna是深度，rna測序是多少m
5樓：倚雲昭陽攬雁聲
由於rna表達的時空和時間的特異性，所以不同時刻或者是同一時刻不同組織內rna表達的數目有著較大的差別，所以我們在說rna的測序資料量時就不能夠用測序深度來表示。一般在說rna測序時會說我們測了多少的cluster, 就是打斷後的rna分子。比如說某一個rna樣本測序用了30m(30million)的cluster,採用雙端測序技術，就是每個cluster從兩端都測一次，每次測150bp,所以就會得到30m*2=60m的reads數，然後reads數乘以每條read的長度就是我們最後的測序資料量（鹼基數），即為60m*150=9g的鹼基數。
6樓：
基因組測序的測序深度一般是10x。
測序深度是指測序得到的總鹼基數與待測基因組大小的比值。假設一個基因大小為2m，測序深度為10x，那麼獲得的總資料量為20m。
基因測序是一種新型基因檢測技術，能夠從血液或唾液中分析測定基因全序列，**罹患多種疾病的可能性，個體的行為特徵及行為合理，如癌症或白血病，運動天賦，酒量等。
什麼是普通的基因測序，它和高通量測序有什麼區別嗎？
7樓：匿名使用者
「普通的基因測序」應該是指「常規dna測序」吧，是用sanger法（也就是雙脫氧法）進行測序的方法，目前非常普遍的是直接用abi 3730xl 進行的自動測序，基本上可以做到600bp-800bp的讀長。
高通量測序的概念其實是一個相對的概念，在2023年的時候，3700、megabace等儀器上的測序也是高通量測序，是相對手工測序或者跑平板膠來說的。
不過到2023年以後，高通量測序就改指第二代測序（next generation sequencing），454、solexa(後改為illumina）和solid等第二代測序，比3730等第一代測序的通量提高了成千上萬倍，甚至上億倍，所以稱為高通量測序。
ngs的特點主要有：
1、通量高，一個run能產生500mb-600gb的資料量
2、讀長相對較短，454(約400-500bp)， illumina（100-250bp）,solid（75-100）
3、單位資料的成本非常低，現在很多專案測序的費用，已經非常低，生物資訊分析成本變得更為重要了。
8樓：匿名使用者
高通量測序深度更深，覆蓋率更高。
奧拓基因是使用美國otoge***ics corporation的技術。公司產品重點是為科研和臨床檢驗提供新一代高通量測序產品和服務。本技術得到了美國國立衛生院創新技術**的支援，以及roche nimblegen和agilent的正式認可。
目前完全符合glp。奧拓已經處理了大量外顯子組樣本大規模的疾病和代謝基因組的高通量測序樣本，以及rna測序（rna-seq）樣本。通過為我們的服務或產品提供書面保證，對每個專案和客戶提供保證，我們已經建立了一個毋庸置疑的高質量的聲譽。
9樓：美吉生物
普通的基因測序即常規測序，高通量測序技術（
high-throughput sequencing）又稱「下一代」測序技術（"next-generation" sequencing technology），以能一次並行對幾十萬到幾百萬條dna分子進行序列測定和一般讀長較短等為標誌。
高通量測序技術是對傳統測序一次革命性的改變，一次對幾十萬到幾百萬條dna分子進行序列測定，因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術(next generation sequencing)足見其劃時代的改變，同時高通量測序使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細緻全貌的分析成為可能，所以又被稱為深度測序(deepsequencing)。
高通量測序技術 中的「高通量」 是什麼意思
10樓：夏維邇
高通量是相對於第一代測序的，第一代測序只能一次測1個樣品的1段序列，產生的資料量相對來說很小，而高通量測序一次能夠產生的資料量在幾十g上百g，可以一次測很多的樣本。
在2023年的時候，3700、megabace等儀器上的測序也是高通量測序，是相對手工測序或者跑平板膠來說的。
不過到2023年以後，高通量測序就改指第二代測序（next generation sequencing），454、solexa(後改為illumina）和solid等第二代測序，比3730等第一代測序的通量提高了成千上萬倍，甚至上億倍，所以稱為高通量測序。
擴充套件資料
高通量測序技術是對傳統測序一次革命性的改變，一次對幾十萬到幾百萬條dna分子進行序列測定，同時高通量測序使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細緻全貌的分析成為可能，所以又被稱為深度測序(deep sequencing)。
利用毛細管測序儀的轉變解決了凝膠板技術內在的通路追蹤問題，毛細管測序儀的自動化顯著提高了處理量，同時提供了更長的可測序長度。這些進展顯著增加了近些年產生的人類病原體的基因組資料。
當前主要的測序技術平臺，主要分為：
1、solexa測序技術（即大家耳熟能詳的illumina測序）；
2、454測序技術（即焦磷酸測序技術）；
3、solid測序技術（雙色編碼技術）。
總體而言，高通量測序技術的誕生可以說是基因組學研究領域一個具有里程碑意義的事件。該技術使得核酸測序的單鹼基成本與第一代測序技術相比急劇下降。
11樓：**ile我的愛人
打個比方，一代測序一次測序只能夠對1個基因進行測序，而高通量測序能夠一次檢測幾十甚至幾百個基因，這就是高通量，同時產生的資料也很巨大，一代測序一次測幾百bp，高通量測序一次測幾個gbp
什麼是普通的基因測序，它和高通量測序有什麼區別嗎
普通的基因測序 應該是指 常規dna測序 吧，是用sanger法 也就是雙脫氧法 進行測序的方法，目前非常普遍的是直接用abi 3730xl 進行的自動測序，基本上可以做到600bp 800bp的讀長。高通量測序的概念其實是一個相對的概念，在2000年的時候，3700 megabace等儀器上的測序...
基因測序中，測序深度為獼猴基因組「11 56倍」的覆蓋率是什麼意思？這裡的倍數是什麼意思
假設一個獼bai猴基因組共有a個鹼基，du那zhi麼這次測序共測出了dao11.56a個鹼基，相當於平內均每一個鹼容基都被測了11.56次。高通量測序是將基因組隨機打斷成小於150bp的片段，之後進行拼接，只有提高覆蓋率，才能保障拼接的準確性。基因組測序中，什麼是測序深度和覆蓋度 測序深度是指bai...
454的測序原理是什麼,高通量測序分的原理是什麼？
454測序原理 焦磷酸測序依靠生物發光進行dna序列分析的新技術 在dna聚合酶,atp硫酸化酶,熒光素酶和雙磷酸酶的協同作用下,將引物上每一個dntp的聚合與一次熒光訊號釋放偶聯起來.通過檢測熒光訊號釋放的有無和強度,就可以達到實時測定dna序列的目的.此技術不需要熒游標記的引物或核酸探針,也不需...