1樓：道峰山營
好做，關鍵是取樣。
簡化基因組方法是一種利用酶切技術、序列捕獲晶片技術或其他實驗手段降低物種基因組複雜程度，進而研究基因組各類遺傳結構性變異的技術手段。目前常見的簡化基因組技術包括rad（restriction site associated dna）和gbs（genotyping by sequencing）。這些技術都可以在極短的時間內開發出成千上萬的snp 標記，而分子標記是開展遺傳作圖、關聯分析、群體遺傳分析以及生態多樣性分析等的基礎，所以利用簡化基因組技術開展科研工作是當前第二代測序技術的一種熱門應用。
做簡化基因組測序，需要懂點啥
2樓：匿名使用者
基因組測序後還需要做race現在全基因組測序用鳥槍法，把所有dna打碎成短片段，測出所有片段的序列再用超級計算機進行拼接。你說的是老方法，先構建大的長片段文庫，這些長片段互相重疊，能涵蓋全部基因組，即所謂的骨架scaffold。然後在對文庫裡每一個克隆進行亞克隆，應該還進行亞亞克隆，得到可以直接測序的短片段克隆，即所謂的可以測序得到reads的克隆。
每個reads的序列拼接起來，逐級拼接，最後得出每一個長片段克隆的序列，最後進行長片段克隆的拼接，得到每一條染色體的序列。實際上老方法就是分級克隆，再拼接，鳥槍法就是直接得到短片段，不經過克隆，對短片段直接測序、拼接。人類基因組計劃最初使用老方法，後來一個公司使用了鳥槍法，最後兩種方法同時完成。
簡化基因組測序和基因組測序的區別
3樓：匿名使用者
一、16s測序原理16srdna基因存在於所有細菌的基因組中，具有高度保守性。然而該基因序列還包括9個高變區（v1-v9），通過特異性引物對某一段高變區（如v3區）或某幾段高變區（如v3-v4區）進行擴增測序，然後與資料庫比對，可特異性識別細菌種類。
二、巨集基因組測序原理將基因組dna隨機打斷成若干條500bp的小片段（類似於拼圖中的單個形狀不一的模組），然後連線接頭（雙端120bp），在片段兩端加通用引物進行pcr擴增測序。將reads進行組裝拼接（類似於將眾多模組拼成一副完整**），得到基因序列，眾多基因構成完整的基因集。同時將獲得的reads片段或組裝好的基因序列與ncbi資料庫進行比對，得到物種註釋結果。
對於16s測序而言，任何一個高變區或幾個高變區，儘管變異性再高，對於某些物種來說，這些高變區也可能十分相近，而能夠區分它們的特異性序列片段有可能不在我們的擴增區域內。換言之，非全長的可變區序列覆蓋範圍不夠導致無法鑑定到種。巨集基因組在建庫之前會先將基因組dna隨機打斷成若干小片段，而這些小片段中總有一些能夠包含區分2個物種的基因差異序列。
由於測序深度足夠深，相當於覆蓋了整個基因組的資訊，因此在與ncbi資料庫比對時，就能夠註釋到相應的種水平的物種。
簡化基因組測序和全基因組測序的區別
4樓：匿名使用者
這個可從佳學基因的不同專案的描術中找到答案。佳學基因的鉑金至尊因解碼採用全基因組測序，而腫瘤風險評估最初的版本是採用snp晶片法。按照佳學基因解的描述。
全基因組測序，測的是全部序列，可以發現別人沒有、您個人獨有的基因序列變化。而晶片只能檢測已知的變化，而且只能是有限的基因序列。盡客snp晶片法檢測成本低，便獲得的資訊的完整性同全基因組測序相比差很遠。
如果您要做罕見疾病的**查詢或者是腫瘤發病原因的查詢，應當選擇佳學基因基於全基因組測序的鉑金至尊基因解碼基因檢測。
基因組重測序有哪些步驟？每個步驟的目的是什麼
5樓：
這個問題要是能夠完美回答就沒有那麼多國內外生物學家仍在努力奮鬥了。事實上
，全基因測序得到就如一本「天書」，我們還是像以前那樣，比如研究某個基因，任然要做很多實驗，各個層次的，分子的蛋白的，研究基因產物的功能結構，和別的蛋白質的關係，受什麼影響，細胞定位如何（遺傳學和分子生物學）。但是有了基因組測序的方便之處也有很多，比如我們很容易去找到這個基因所在位置，是否有突變，在生信方面可以**其結構、功能，找同源基因，系統發育樹等（生物資訊學），對於低階的模式生物，甚至可以建整個基因組、蛋白組、代謝組的網路（系統生物學），用於研究高通量資料等等。總之，想回答這個問題，得深入學習我上面提到的學科，並研究下現在的科研文獻，才能較為全面的瞭解。
不過看你想知道的深度了。
新一代測序中，基因從頭測序和重測序有什麼區別？我要做乙肝病毒dna全長測序，應該選用哪種方法？
6樓：那年丶人已散盡
1、條件不同
從頭測序的條件是不依賴於任何物種基因組；重測序的條件是在已知物種基因組的情況下進行的。
2、病毒變異率不同
從頭測序是通過拼接和組裝的方式獲得基因組序列圖譜，病毒變異率很低；重測序可以尋找出大量的單核苷酸多型性位點，插入缺失位點，結構變異位點，拷貝數變異等變異資訊，從而獲得生物群體的遺傳特徵。病毒變異率很高。
乙肝病毒在醫學上已經測過，只需要做重測序就可以。
7樓：匿名使用者
從頭測序是目前為止還沒有人測過那個物種的全基因組，沒有參考序列進行比對，需要自己組裝拼接後才能知道序列；而重測序是已經有人測過了，只需要重新測序，有參考序列了，只需要與參考序列比對。
乙肝病毒好像是已經測過的，只需要做重測序就可以！
8樓：美吉生物
基因從頭測序也叫做基因de novo測序，是指不依賴於任何已知基因組序列資訊對某個物種的基因組進行測序，然後應用生物資訊學手段對測序序列進行拼接和組裝，最終獲得該物種基因組序列圖譜。
重測序是指在已知物種基因組的情況下，對物種內的不同個體或某個個體的不同組織進行基因組重測序，可以在全基因組水平上發現不同個體或組織細胞之間的差異。通過這種方法，可以尋找出大量的單核苷酸多型性位點（snp），插入缺失位點（indel，insertion deletion），結構變異位點（sv，structure variation），拷貝數變異（copy number variation，**v）等變異資訊，從而獲得生物群體的遺傳特徵。
病毒變異率很高，一般不用重測序，可以用de novo從頭測序。
9樓：匿名使用者
專業性東西，自己看看這個
資料
基因測序中，測序深度為獼猴基因組「11 56倍」的覆蓋率是什麼意思？這裡的倍數是什麼意思
假設一個獼bai猴基因組共有a個鹼基，du那zhi麼這次測序共測出了dao11.56a個鹼基，相當於平內均每一個鹼容基都被測了11.56次。高通量測序是將基因組隨機打斷成小於150bp的片段，之後進行拼接，只有提高覆蓋率，才能保障拼接的準確性。基因組測序中，什麼是測序深度和覆蓋度 測序深度是指bai...
dna甲基化全基因組測序需要完整的基因組註釋嗎
測序覆蓋度 基因組被測序得到的鹼基覆蓋的比例 測序覆蓋度是反映測序隨機性的指標之一 測序序深度與覆蓋度之間的關係可以過lander waterman model 1988 來確定。當深度達到5x時，則可覆蓋基因組的約99.4 以上。全基因組測序有什麼意義？隨著全球經濟形勢的變化，每個人一生都應該做一...
全基因組甲基化測序,應該測多少,全基因組甲基化測序需要做重複嗎
測序覆蓋bai度 基因組被測序得到 du的鹼基zhi覆蓋的比例 測序覆dao蓋度是反映 版測序隨機性的指權標之一 測序序深度與覆蓋度之間的關係可以過lander waterman model 1988 來確定。當深度達到5x時,則可覆蓋基因組的約99.4 以上。全基因組甲基化測序需要做重複嗎 不用做...