1樓：匿名使用者
代謝通路：目前在通路資料庫(pathway database) 中代謝通路是建立得最好的，有大約90個參考代謝途徑的圖形。每個參考代謝途徑是一個由酶或ec號組成的網路。
利用如下方法可通過計算機構建出生物體特有 的代謝通路：
先根據基因的序列相似性和位置相關性確定基因組中酶的基因。
然後合理地安排ec號。
最後將基因組中的基因和參照通路中用ec號編號的基因產物 結合起來。
怎麼做基於kegg的生物通路富集分析
2樓：小盆友的
如何利用kegg定位基因屬於哪個代謝通路
代謝通路：目前在通路資料庫(pathway database) 中代謝通路是建立得最好的，有大約90個參考代謝途徑的圖形。每個參考代謝途徑是一個由酶或ec號組成的網粻丁綱股蕺噶告拴梗莖絡。
利用如下方法可通過計算機構建出生物體特有 的代謝通路：
先根據基因的序列相似性和位置相關性確定基因組中酶的基因。
然後合理地安排ec號。
最後將基因組中的基因和參照通路中用ec號編號的基因產物 結合起來。
什麼是go富集分析，常說的go功能分析、功能分析、pathway分析是什麼意思？
3樓：
gene ontology可分為分子功能（molecular function），生物過程（biological process）和細胞組成（cellular ***ponent）三個部分。蛋白質或者基因可以通過id對應或者序列註釋的方法找到與之對應的go號，而go號可對於到term，即功能類別或者細胞定位。
功能富集分析: 功能富集需要有一個參考資料集，通過該項分析可以找出在統計上顯著富集的go term。該功能或者定位有可能與研究的目前有關。
go功能分類是在某一功能層次上統計蛋白或者基因的數目或組成，往往是在go的第二層次。此外也有研究都挑選一些term，而後統計直接對應到該term的基因或蛋白數。結果一般以柱狀圖或者餅圖表示。
1.go分析
根據挑選出的差異基因，計算這些差異基因同go 分類中某（幾）個特定的分支的超幾何分佈關係，go 分析會對每個有差異基因存在的go 返回一個p-value，小的p 值表示差異基因在該go 中出現了富集。
go 分析對實驗結果有提示的作用，通過差異基因的go 分析，可以找到富集差異基因的go分類條目，尋找不同樣品的差異基因可能和哪些基因功能的改變有關。
2.pathway分析
根據挑選出的差異基因，計算這些差異基因同pathway 的超幾何分佈關係，pathway 分析會對每個有差異基因存在的pathway 返回一個p-value，小的p 值表示差異基因在該pathway 中出現了富集。
pathway 分析對實驗結果有提示的作用，通過差異基因的pathway 分析，可以找到富集差異基因的pathway 條目，尋找不同樣品的差異基因可能和哪些細胞通路的改變有關。與go 分析不同，pathway 分析的結果更顯得間接，這是因為，pathway 是蛋白質之間的相互作用，pathway 的變化可以由參與這條pathway 途徑的蛋白的表達量或者蛋白的活性改變而引起。而通過晶片結果得到的是編碼這些蛋白質的mrna 表達量的變化。
從mrna 到蛋白表達還要經過microrna 調控，翻譯調控，翻譯後修飾（如糖基化，磷酸化），蛋白運輸等一系列的調控過程，mrna 表達量和蛋白表達量之間往往不具有線性關係，因此mrna 的改變不一定意味著蛋白表達量的改變。同時也應注意到，在某些pathway 中，如egf/egfr 通路，細胞可以在維持蛋白量不變的情況下，通過蛋白磷酸化程度的改變（調節蛋白的活性）來調節這條通路。所以晶片資料pathway 分析的結果需要有後期蛋白質功能實驗的支援，如western blot/elisa，ihc（免疫組化），over expression（過表達），rnai（rna 干擾），knockout（基因敲除），trans gene**基因）等。
3.基因網路分析
目的：根據文獻，資料庫和已知的pathway 尋找基因編碼的蛋白之間的相互關係(不超過1000 個基因)。
從福州到廣西南寧最快最便宜的交通路線是怎樣的
1 全程約1423.4公里。2 有直達的汽車，看圖 3 火車的話沒有直達的，要坐比汽車更加長的時間的。動車快的路線 福州 深圳 廣州南站 南寧站。如果你坐火車，我就不懂你要出發的具體時間了。你自己到 12306中國鐵道中心網上去檢視。不用謝。可以先做飛機去桂林，大概 350，然後在轉動車去南寧120...
學習《數學分析課程》的心得及其領悟到的方法
這個，對於常常掛科的俺，本不應該來回答的。但是，你要知道不掛科的大學不是完整的大學。還有，這門課是天書級別的，學不好正常，不過，不要灰心。建議多做一些動手的智力遊戲。比如魔方，比如轉筆。可以開發邏輯思維。還有建議看看偵探方面的書，既不使學習變得枯燥，又可以鍛鍊推理能力。對證明題大有裨益。還有，我特意...
為什麼每次到天氣冷的時候，秋天冬天的時候，我一洗頭髮就要掉很多頭髮啊
秋季是脫髮最明顯的季節。夏秋季節更替之時，毛囊因受夏季紫外線照射及高溫的影響，受到一定的傷害。秋季氣溫驟然下降，毛囊收縮加快，對營養不足或嚴重受損害的毛囊會造成萎縮，長出細小頭髮或不長頭髮，造成頭髮越來越少。秋季脫髮是一種正常生理現象，如果每天不超過100根就無需慌張。保證充足的睡眠可以促進 及毛髮...