1樓:匿名使用者
定量反轉錄pcr技術,通過該技術反映出rna載量
什麼是realtime pcr,什麼是q-pcr,所用反應物質與普通pcr有何不同
2樓:任羿
由於pcr敏感性高,擴增產物總量變異係數大,定量不準確。90年代末期出現了q-pcr, 利用熒光檢測pcr儀繪製dna擴增過程中的累積速率動態變化圖,基本消除在測定終端產物丰度時變異係數較大的問題。混合在pcr反應液中的熒光探針只有與雙鏈dna結合後,才能夠被激發出熒光。
隨著新合成dn**段的增加,由於結合到dna上的熒光探針增加,被激發產生的熒光相應增加。
為確保熒光檢測的確實是靶dna,又設計了僅能與目的dna特異結合的熒光探針。taqman探針是一段與靶dna序列中間部位結合的單鏈dna,長50bp-150bp,該dna的5』和3』端帶有短波長和長波長兩個不同熒光基團,由於彼此距離靠近,在熒光共振能量轉移(fret)作用下發生熒光淬滅,因而檢測不到熒光。隨著pcr反應的進行,taqman 探針結合到目的dna序列上,並且會被具有外切酶活性的taq dna聚合酶逐個切除而降解。
切下來的熒光基團解除了熒光淬滅的束縛,會在激發光下發出熒光,因此,產生的熒光強度直接反映了所擴增靶dna的總量。
實時定量pcr的引數:ct值
ct值是產物熒光強度首次超過設定閾值時,pcr反應所需的迴圈數。實時定量pcr可定量比較各樣本之間待檢測靶dna多少,顯示的是各樣本之間的相對含量。利用標準曲線,可以確定樣品中待檢測靶dna的絕對含量。
以上是我們上課課件上的內容。反應物質的話,就是多加了熒光染料。real time q-pcr就是實時定量pcr。
3樓:匿名使用者
所謂real-time q-pcr技術,是指在pcr反應體系中加入熒光基團,利用熒光訊號累積實時監測整個pcr程序,最後通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。利用熒光訊號的變化實時檢測pcr擴增反應中每一個迴圈擴增產物量的變化,通過ct值和標準曲線的分析對起始模板進行定量分析。
pcr,rt-pcr,實時熒光定量pcr的區別與聯絡
4樓:永恆的瞬間綻放
1、所說的pcr應該就是最常規的pcr,以dna為模板,通過上下游引物,實現dna的擴增。
2、rt-pcr一般情況下是指反轉錄pcr(reverse transcription),儘管有些資料上說實時熒光定量pcr也(realtime fluores-cence quantitative pcr)也簡稱rt-pcr,但是這是不對的,不推薦。
基本操作過程是將所提取的rna進行反轉錄,然後將所獲得的cdna作為模板,設計引物進行擴增,是一種檢測基因表達的常用方法。
3、實時熒光定量pcr也就是real-time pcr,其最大的作用是檢測樣品中的初始dna濃度。
至於三者的關係,rt-pcr和實時定量pcr應該都屬於pcr,在rna實驗中,這二者都會應用到。
例如你要比較2個組織中的某基因的表達差異,首先你要提取2個組織的總rna,然後通過rt-pcr檢測該基因是否在2個組織中有表達,然後通過實時定量pcr測定該基因在2個組織中的表達量是否具有顯著性差異。
擴充套件資料:
pcr原理
dna的半保留複製是生物進化和傳代的重要途徑。雙鏈dna在多種酶的作用下可以變性解旋成單鏈,在dna聚合酶的參與下,根據鹼基互補配對原則複製成同樣的兩分子拷貝。
在實驗中發現,dna在高溫時也可以發生變性解鏈,當溫度降低後又可以復性成為雙鏈。因此,通過溫度變化控制dna的變性和復性,加入設計引物,dna聚合酶、dntp就可以完成特定基因的體外複製。
但是,dna聚合酶在高溫時會失活,因此,每次迴圈都得加入新的dna聚合酶,不僅操作煩瑣,而且**昂貴,制約了pcr技術的應用和發展。
耐熱dna聚合酶-taq酶的發現對於pcr的應用有里程碑的意義,該酶可以耐受90℃以上的高溫而不失活,不需要每個迴圈加酶,使pcr技術變得非常簡捷、同時也大大降低了成本,pcr技術得以大量應用,並逐步應用於臨床。
pcr技術的基本原理類似於dna的天然複製過程,其特異性依賴於與靶序列兩端互補的寡核苷酸引物。pcr由變性-退火-延伸三個基本反應步驟構成:
①模板dna的變性:模板dna經加熱至93℃左右一定時間後,使模板dna雙鏈或經pcr擴增形成的雙鏈dna解離,使之成為單鏈,以便它與引物結合,為下輪反應作準備;
②模板dna與引物的退火(復性):模板dna經加熱變性成單鏈後,溫度降至55℃左右,引物與模板dna單鏈的互補序列配對結合;
③引物的延伸:dna模板-引物結合物在72℃、dna聚合酶(如taqdna聚合酶)的作用下,以dntp為反應原料,靶序列為模板,按鹼基互補配對與半保留複製原理,合成一條新的與模板dna鏈互補的半保留複製鏈,重複迴圈變性-退火-延伸三過程就可獲得更多的「半保留複製鏈」,
而且這種新鏈又可成為下次迴圈的模板。每完成一個迴圈需2~4分鐘,2~3小時就能將待擴目的基因擴增放大幾百萬倍。
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