1樓：鵝子野心
分析新的基因方法：
工具/原料
基因表達資料的csv檔案
資料的分組資訊的csv檔案
excel
準備資料檔案
1首先我們需要一個表達譜資料的csv檔案表。這些基因表達資料一般是在實驗結束之後就會產生，是我們分析的原始檔。
表達譜的格式為：
檔案的a1單元格留白；
檔案的第一行，寫的是樣本的唯一識別號，這個識別號可以自行指定，但請確保每個樣本為一列且識別號都不同。
檔案的第一列（a列)，寫的是基因簡稱，每個基因在hgnc**的列表中都有且唯一。
資料格式如圖所示：
2其次我們需要一個記錄著表達譜資料的**和分組的csv檔案表。
這一個csv檔案記錄著每一個樣本的分組和其他資訊。
分組資訊表的格式為：
檔案的a1單元格留白；
檔案的第一列（a列)，寫的是樣本的唯一識別號，這個識別號與表達譜資料表中的樣本識別號一一對應。
檔案的第一行則記錄著對應的分組資訊，並且分組資訊一般命名為groups。
資料格式如圖所示：
end進行分析
1登入基因雲館，右上角點登入系統。輸入賬號密碼進行登入。沒有賬號可以快速免費註冊一個。
2右側選擇 「預處理 > 表達集生成器」。
將上一步準備好的檔案「表達譜資料的csv表檔案」放入matrix；
「表達譜分組資訊的csv表檔案」放入pdata；
最後填寫一個savename表示儲存檔案的檔名。
點選執行
3生成與步驟2中的savename填寫的檔名對應的rdata資料檔案就可以進行後續的差異分析了。
同時，最好點選eset_create.html報告檢視生成的檔案的簡要資訊。
end差異基因分析
右側選擇「差異分析 > 差異基因分析」；
在inputset*欄目裡放入上一步生成的rdata，剩餘引數如下選擇。
logfc代表倍增關係，一般是1-2，這裡請選擇1，如果差異基因過少可以適當降低；
pvalue代表p值，一般選擇0.05，這裡即選擇0.05，如果差異基因過多可以適當降低；
genenamesets代表要單獨顯示錶達變化的基因，這裡填寫可以 ahnak2；
點選「執行」進行分析。
分析時間長度約為1-2分鐘；
點選結果頁面的deg_gene.html連結，檢視結果報告。
差異基因的結果也就做出來了。你也可以試試其他引數，獲得理想的結果。
如何完整的研究一個基因的功能
2樓：血刺啊姍灠
這個問題可大了。我覺得每個人能說一部分，但是說全了太難了，遺傳學的研究方法足以寫一本書。我想到這些：
在動物上 過表達/敲除或敲落 系統地分析表型，進一步分析機制。考慮到基因表達的時間空間特異性，這種人工的上調或下調基因表達就有了許多種時間、空間的組合，可能會得到不同的結果，當然這些結果不一定矛盾，而可以是互補的。
如果基因的功能域不清楚，可以在瞭解主要表型的基礎上截短、缺失基因的一部分，以發現和了解各功能域的功能。
但以上方法的存在缺點。改變目的基因表達水平可能會導致一些後續變化，使生物過程偏離正常狀態，從中既可以進行分析瞭解其功能，也可能從變化了的生物體中得到異於實際情況的錯誤結論。
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