1樓:e丶時代巨蟹
illumina近日宣佈,其測序平臺的軟體有了突破性的改進,能進行實時分析,並顯著降低了計算機執行設施的需求。這些軟體改進,再加上新的genome analyzer iix,讓研究人員相對genome analyzer ii而言,測序產量能提高65%。然而,與當今資料越多,所需的計算能力也要相應提高的趨勢截然相反,illumina正通過實現儀器控制工作臺的鹼基檢出和質量評估,來簡化計算和資料處理。
illumina進一步優化了影象處理和資料分析,來支援測序產量的提高。軟體改進包括改良的簇檢測,每個流動池的讀長增加40%,更低的錯誤率。演算法優化上的突破讓標準的儀器控制檯能將實時的鹼基檢出和資料處理相整合,而無需轉移大的資料檔案,並將資料儲存的需要最小化。
最新的genome analyzer iix創新實現了資料產量和質量的顯著提高,代表了genome analyzer開發道路上一個重要的里程碑。新產品簡化了從樣品製備到資料分析的流程,增加了資料產量和質量,並擴充套件了genome analyzer的應用。
genome analyzer iix有兩個核心特徵:其一是更大的試劑冷卻器,支援超過100個測序迴圈,進一步提升了系統的易用性和自動化;其二是全新的流動池支架,讓每輪執行所得的高質量資料增加20%。依靠這些軟體和試劑的改進,genome analyzer iix現在能夠100 bp以上的配對末端讀長,並在每次執行中產生超過20 gb的高質量資料。
genome analyzer ii的使用者只需訂購genome analyzer iix upgrade kit,就能輕鬆升級到全新的系統。
2樓:
illumina二代測序的比較完整的介紹,比如什麼是文庫,什麼是測序深度
3樓:匿名使用者
基因bai測序(分為 dna 和 rna)是指通過一定du的技術手zhi段分析 dna
或者 rna 片段
dao中的鹼基序列,也就是腺版
嘌呤(a)、胸權腺嘧啶(t,rna 為尿嘧啶 u)、胞嘧啶(c)與鳥嘌呤的(g)排列方式,從而為生物學 和醫學的研究發現提供支援。
評價測序技術有多個重要的引數(圖表 1),這些引數之間存在相關 性,比如測序讀長越長,讀段後半部分的鹼基測序準確率都會比較低。 測序技術的評價應該綜合考慮這些引數。
illumina測序技術術語 lane和run是什麼意思
4樓:匿名使用者
illumina的測序儀是以flowcell進行測序的,一般的一張flowcell是一個run,像hiseq2500的話是2張flowcell,也就是一次執行專的測序量屬。每張flowcell上通常都有多個通道,每個通道可以單獨測不同的樣品,這樣的通道就是lane。hiseq2500的一張flowcell有8條通道,也就是8個lane。
如果上機前使用cbot的話可以每條lane都跑不同的樣品,互不干擾,如果直接上機進行快速模式的話就無法區分不同樣本了。
基因組高通量測序的原理
5樓:暴走少女
測序方案建立在雙脫氧測序法(sanger等,1977)的基礎上。為了從每一克隆插入片段兩端成對地進行測序,每一個質粒模板dna板應配備兩個384孔迴圈測序反應板。
機械臂負責等分模板試樣,起與反應液混合的作用,反應液含有雙脫氧核苷酸、熒游標記的核苷酸、taqdna聚合酶、序列引物和緩衝液。
模板和反應板有條形碼,且在biomekfx移液操作工作站上有條形碼讀取器跟蹤,確保模板和反應液轉移中沒有錯誤。30~40線性擴增步驟連續迴圈在mjresearchtetrads或9700熱迴圈儀(ap—pliedbiosystems)中進行。
illumina測序儀可以一次測多少個文庫
6樓:
是按資料量計算的,每個lane(可以理解為泳道或者上樣槽),每個lane有固定的資料產出,所以如果文庫上樣量大,則上的文庫就少,反之文庫多
illumina測序資料檔案有多大
illumina近日宣佈,其測序平臺的軟體有了突破性的改進,能進行實時分析,並顯著降低了計算機執行設施的需求。這些軟體改進,再加上新的genome analyzer iix,讓研究人員相對genome analyzer ii而言,測序產量能提高65 然而,與當今資料越多,所需的計算能力也要相應提高的...
如何看懂基因測序的circo圖
拷貝數變異 bai copy number variation,cnv 是由基因du 組發zhi生重排而導致的,一般指長dao度為1 kb 以上的基因 組大片段的版 拷貝數增加或權者減少,主要表現為亞顯微水平的缺失和重複。cnv 是基因組結構變異 structural variation,sv 的重...
如何找到真愛,怎麼找到真愛?
有一天,一個青年來到一位教授家裡,教授,請問,怎麼樣才能得到真愛呢?教授沒有直接回答他,你到郊外農場的麥地裡去,找一根你認為長的最好的麥子。記住,只能一直向前走,不能回頭,跟不能摘走過的麥子。青年出發了。好幾個小時過去了,青年垂頭喪氣的回來了,手裡一根麥子都沒有。為什麼會沒摘麥子就回來了呢?教授問。...